عناصر مشابهة
Synthesis and Molecular Dynamics Simulation of Putative Inhibitors for the N-terminal Domain of Human Soluble Epoxide Hydrolase
| العنوان بلغة أخرى: | تحضير و محاكاة باستخدام الديناميكا الجزيئية لمثبطات محتملة لجانب الطرف (N) للإنزيم البشري الذائب الإيبوكسايد هيدرولاس |
|---|---|
| الناشر: |
الزرقاء
|
| المؤلف الرئيسي: | |
| مؤلفين آخرين: | , |
| التاريخ الميلادي: | 2009 |
| الصفحات: | 1 - 65 |
| رقم MD: | 748221 |
| نوع المحتوى: | رسائل جامعية |
| اللغة: | English |
| قواعد المعلومات: | Dissertations |
| الدرجة العلمية: | رسالة ماجستير |
| الجامعة: | الجامعة الهاشمية |
| الكلية: | عمادة البحث العلمي والدراسات العليا |
| مواضيع: | |
| رابط المحتوى: |
|
| المستخلص: | اكتشف حديثا أن جانب الطرف (N) للإنزيم البشري الذائب الإيبوكسايد هيدرولاس يقوم بوظيفة الفوسفاتس ((phosphatase. تم استخدام المحاكاة الجزيئية الديناميكية في العملِ الحاليِ لدراسة التفاعل بين ثلاثة منِ مثبطي نشاط الفوسفاتس .(A, B and C) الجدير بالذكر أن دراسة حديثة بينت أن مركب A له فاعلية عالية كمانع لنشاطِ الفوسفاتس للإنزيم البشري الذائب الإيبوكسايد هيدرولاس مع µM 0.84 =IC50. كشفت نتائج العمل الحالي بأن الذيل الهيدروفوبي لكل مثبط يستقر في الشق الهيدروفوبيِ لجانب الطرف (N) بينما يشكل الرأس القطبي روابط في داخل الموقع النشيط للإنزيم Mg2+-aspertate والسلاسل الجانبية للحوامض الأمينيةِ القطبيةِ والمشحونة القريبة. حللت المسارات التي تم الحصول عليها لكل معقد من خلال المحاكاة الجزيئية الديناميكية لدِراسَة الروابط الهيدروجينية بين الإنزيمِ وكل مثبط و دراسة دور أيون Mg2+ في عملية التعرف على المثبط. هذا وقد تم استخدام طريقة بويزن بولتزمان/ المساحة السطحية المعتمدة على الميكانيكا الجزيئية لتحديد قيمة الطاقة الحرة لتكوين معقد أنزيم/مثبط. أظهرت النتائج بأن تفاعلات الكهروستاتيكية المتشكلة بين الضيف والمضيف لَها المساهمة الأكبر في إستقرارِ المعقد. وأظهرت النتائج أيضاً أن تفاعلات فان دير فالز لها مساهمة هامة في استقرار المعقد. كشفت النَتائج أن ثباتية المعقد المتشكل من المثبط B و الإنزيمِ أكثر استقرارا بمقدار kcal/mol30 مقارنة بالمثبط A. |
|---|
