عناصر مشابهة
Applicability of Fibrous Cellulose –D In Extracting Double-Stranded RNA "dsRNA" of ToBRFV
| العنوان بلغة أخرى: | قابلية تطبيق السليلوز الليفي "D" في استخراج الحمض النووي الريبي مزدوج الشريطة "dsRNA" من "ToBRFV" |
|---|---|
| المصدر: | جرش للبحوث والدراسات |
| الناشر: |
جامعة جرش
|
| المؤلف الرئيسي: | |
| مؤلفين آخرين: | , , , |
| المجلد/العدد: | مج24, ع1 |
| محكمة: | نعم |
| الدولة: | الأردن |
| التاريخ الميلادي: | 2023 |
| التاريخ الهجري: | 1445 |
| الصفحات: | 443 - 451 |
| DOI: | 10.36091/0550-024-001-018 |
| ISSN: | 1814-2672 |
| رقم MD: | 1449380 |
| نوع المحتوى: | بحوث ومقالات |
| اللغة: | English |
| قواعد المعلومات: | EduSearch EcoLink AraBase HumanIndex |
| مواضيع: | |
| رابط المحتوى: |
|
| المستخلص: | تعد المتسلسلة الثنائية من الحمض النووي الريبي (dsRNA) ميزة فريدة لفيروسات الحمض النووي الريبي النباتية التي تستخدم للكشف العام عن فيروسات النبات. لعقود؛ تم استخدام السليلوز الليفي- 11 (CF11) لتنقية استخلاص (dsRNA)، ولكن هذا السيليلوزلم يعد ينتج مؤخرا. تم اقتراح السليلوز الليفي (CF-A،-B ،-C ،-D ، و- E) كبدائل له. تهدف هذه الدراسة إلى تقييم قابلية تطبيق وتكرار استخدام CF-D مع طريقتين مختلفتين لاستخراج الحمض الريبي النووي (dsRNA): عمود الطرد المكزي الدقيق وطريقة Dodds المعدلة. تم تسجيل أفضل النتائج باستخدام طريقة استخلاص Dodds. حيث أكدت هذه النتائج أيضا قابلية تطبيق استخراج الحمض النووي الريبي من الأنسجة النباتية المصابة باستخدام CF-D كبديل لـ CF-11. ومن المثير للاهتمام أن العينة التي كانت تظهر عليها أعراض ToBRFV ولكن تم اختبارها سلبا بواسطة تفاعل البوليمراز المتسلسل للنسخ العكسي RT-PCR؛ أظهرت عن حزمة (6000bp تقريبا) وهو الحجم التقريبي لفيروس (ToBRFV) وهكذا، فإن تنقية (dsRNA)، تؤكد قابليته للتطبيق في الكشف عن متغيرات الحمض النووي الريبي للفيروسات. وحسب أفضل ما لدينا من معلومات، فإن هذا البحث هو الأول الذي يتم إجراؤه على CF-D وكذلك التوصية باستخدامه على طريقة استخراج Dodds المعدلة. علاوة على ذلك، يوصى بشدة بالبحث في تطبيق CF-D لاستخراج الحمض النووي الريبي. (RNA) The viral replicative form double strand RNA (dsRNA) is a unique feature to the plant RNA viruses that used for non-specific detection of plant viruses. For decades; fibrous cellulose -11 (CF11) was used for dsRNA purification, but recently was no-more produced. Other fibrous celluloses (CF-A; -B; -C; -D; and –E) were suggested as alternatives to CF11. This study was to evaluate the applicability and reproducibility of using CF-D with two different dsRNA extracting methods: micro-spin column and modified Dodds extraction methods. The best results were recorded on Dodds extraction method over micro-spin one. This results also confirmed the applicability of extracting dsRNAs from infected plant tissues with CF-D as an alternative to CF-11. Interestingly, the sample which was exhibiting Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) symptoms but negatively tested by reverse transcription-plymerase chain reaction (RT-PCR); were exhibited band (~6000 bp) approximate size of the suspected ToBRFV. Thus, dsRNA emphasizing its applicability in detecting the RNA variants of the virus. From the best of our knowledge, this research was the first to be conducted and recommending using CF-D in modified Dodds extraction method. Moreover, research on applying CF-D for RNA extraction would be highly recommended. |
|---|
